События второй части основаны на комиксах Марвел, об "Эре Эльтрона". С момента, когда супергерои были собраны мощной организацией "ЩИТ" прошло несколько лет. Компания мстителей распалась, а герой стали жить самостоятельной жизнью. Они по одиночке охраняли порядок во всем мире. Человечество всегда пыталось создать искусственный интеллект, который будет служить на благо людям. В попытках сделать такой продукт были задействованы лучшие умы всей планеты. И, наконец, им удалось сотворить шедевр в этой области - искусственный интеллект под названием Альтрон. Однако, он вышел из-под контроля и теперь именно он стал настоящей угрозой для всей планеты, в частности для человечества. В этот самый момент легендарные супергерои вновь получают клич собраться в единую команду теперь уже от угнетенных жителей планеты Земля.